《植物大战僵尸2》还加入了手势操控的技能，基本都是针对于消灭僵尸的，共有三种，分别为双指指捏、单指拖动以及单指点击滑动。游戏中也是分别以绿色、黄色以及紫色的图标来代替，启动这项技能的方法就是点击屏幕下方对应的颜色图标。

植物大战僵尸2手指操控

     当玩家启动技能之后，整屏区域将会以逆时针的方向提示玩家技能使用所剩时间，这个时候玩家只需在有限的时间内利用手势操控去消灭僵尸即可。

   “双指指捏”的意思是说玩家在僵尸的头部做双指合拢的动作即可；“单指拖动”是指玩家滑动一个或多个僵尸将它们拖到空中，之后向右甩动扫出屏幕即可；而“单指点击滑动”是最好理解的，玩家点住一个僵尸然后手指不离开屏幕并滑向其他僵尸就可以将它们全部电击致死了。

    此外，《植物大战僵尸2》中设置了多种迷你模式，每个迷你模式还会有3个等级的进阶，从易到难。二代作品中，迷你模式会以直线关卡的形式出现在各大地图中，下面就来介绍几个迷你模式：

   保护我们的种子：此迷你模式要求玩家保护游戏预置在战场中的植物不受僵尸损害，预置的位置会让玩家抓狂，如果你不仅对预置的位置不满，还对预置的植物不满，那么不妨试试铲掉它们……

植物大战僵尸2迷你模式

    木乃伊记忆：此模式不需要种植物，出场僵尸也只有骆驼僵尸，当翻开两张相同的图案时就可以打倒僵尸，在僵尸到达你的宫殿前消灭场上全部僵尸就可以通关了。

植物大战僵尸2迷你模式

    失去大炮：此模式仅提供5台椰子加农炮，必须在游戏结束时达到规定的分数才能通关。由于椰子加农炮每发射一次就需要休息一段时间，所以如何把握好时机，用最少的炮弹轰炸最多的僵尸成为了制胜的关键。另外，玩家还需要注意的是如果考虑的太久，海鸥僵尸们就会飞回海盗船上去睡大觉了。

植物大战僵尸2迷你模式

    在《植物大战僵尸2》中，除了主线关卡和支线关卡，每张地图都有一个隐藏关卡，只有在完成当前地图中的全部主线关卡后才会解锁。隐藏关卡的游戏模式类似一代中的挑战模式，但是难度更大。